Riboflavin fosforyleres ved absorpsjon til flavinmononukleotid (FMN) som i andre vev kan koples til adenosinmonofosfat og danne flavin adenin dinukleotid (FAD). Både FMN og FAD fungerer som kofaktorer i utallige enzymatiske reaksjoner; eksempler: FMN inngår i elektrontransportkjeden og i aminosyreoksidaser, FAD inngår i 3 trinn i Krebssyklus og 1 trinn i fettsyreoksidasjonen. Kanaliserer elektroner inn i elekstrontransportkjeden.